Auto-entrepreneur : guide complet de la facturation en 2026

Devenir auto-entrepreneur, c'est se lancer rapidement dans l'activité avec un cadre administratif simplifié. Mais simplifié ne veut pas dire sans obligation. La facturation est un sujet sur lequel de nombreux micro-entrepreneurs commettent des erreurs, parfois sans le savoir, et s'exposent à des sanctions de l'administration fiscale ou de l'URSSAF.

En 2026, les règles évoluent encore avec l'arrivée de la facturation électronique obligatoire. Ce guide fait le point complet sur tout ce que vous devez savoir pour facturer correctement en tant qu'auto-entrepreneur : obligations légales, mentions spécifiques, numérotation, conservation, déclaration, et choix du bon logiciel. Consultez aussi notre guide sur la franchise de base TVA et le régime micro-entreprise.

Les obligations de facturation de l'auto-entrepreneur

Quand êtes-vous obligé d'émettre une facture ?

En tant qu'auto-entrepreneur, vous devez obligatoirement émettre une facture dans les cas suivants :

• Toute prestation ou vente à un professionnel (B2B) : c'est systématique, quel que soit le montant.
• Toute vente de marchandises à un particulier (B2C) supérieure à 25 euros, ou si le client en fait la demande.
• Toute prestation de services à un particulier, si le client demande une facture ou si le montant dépasse 25 euros TTC.
• Les ventes à distance (e-commerce) : une facture est toujours obligatoire.

En pratique, il est recommandé de facturer systématiquement, même quand ce n'est pas obligatoire. Cela structure votre comptabilité, facilite vos déclarations URSSAF et vous protège en cas de litige.

Les délais d'émission

La facture doit être émise :

• Pour les ventes de biens : au moment de la livraison
• Pour les prestations de services : à la fin de la prestation ou selon la périodicité convenue (mensuelle, par exemple)
• Dans tous les cas : au plus tard le jour de la livraison ou de la réalisation de la prestation

Le retard ou l'absence d'émission de facture est passible d'une amende de 75 000 euros pour une personne physique.

Les mentions obligatoires sur vos factures

Mentions communes à toutes les factures

Chaque facture émise par un auto-entrepreneur doit comporter les mentions suivantes :

• Numéro de facture : unique et séquentiel (voir section numérotation ci-dessous)
• Date d'émission de la facture
• Identité du vendeur : nom et prénom (ou dénomination sociale), adresse, numéro SIRET, code APE/NAF
• Identité du client : nom (ou raison sociale), adresse
• Numéro du bon de commande s'il en existe un
• Désignation des produits ou services : nature, quantité, prix unitaire HT
• Montant total de la facture
• Date de la vente ou de la prestation
• Date d'échéance du paiement et conditions de règlement
• Taux des pénalités de retard applicables
• Montant de l'indemnité forfaitaire de recouvrement : 40 euros (obligatoire pour les factures B2B)
• Numéro SIREN de l'acheteur (pour les transactions B2B, obligatoire depuis 2024)

Mentions spécifiques à l'auto-entrepreneur

En plus des mentions communes, certaines mentions sont propres au statut de micro-entrepreneur :

Si vous ne facturez pas la TVA (franchise en base de TVA) :

La mention obligatoire à faire figurer est : "TVA non applicable, article 293 B du Code général des impôts"

Cette mention remplace toute référence à la TVA. Vous n'indiquez pas de taux de TVA, pas de montant HT/TTC distinct. Le montant facturé est le montant total.

Si vous avez dépassé les seuils et êtes redevable de la TVA :

Vous devez dans ce cas indiquer votre numéro de TVA intracommunautaire, le taux de TVA applicable et distinguer le montant HT du montant TTC. En 2026, les seuils de franchise de TVA sont :

• 37 500 euros pour les prestations de services (seuil de base)
• 85 000 euros pour les activités de vente de marchandises (seuil de base)

Mention obligatoire d'assurance professionnelle :

Si votre activité nécessite une assurance professionnelle obligatoire (BTP, conseil, professions réglementées), vous devez mentionner sur chaque facture :

• L'assurance souscrite au titre de l'activité
• Les coordonnées de l'assureur ou du garant
• La couverture géographique du contrat

Mention RCS ou RM :

• Si vous êtes commerçant : numéro d'immatriculation au Registre du Commerce et des Sociétés (RCS) suivi du nom de la ville du greffe
• Si vous êtes artisan : numéro d'immatriculation au Répertoire des Métiers (RM)
• Depuis le Registre National des Entreprises (RNE), ces informations sont regroupées mais restent obligatoires sur les factures

La numérotation des factures

Les règles à respecter

La numérotation de vos factures doit suivre des règles strictes :

• Séquence chronologique continue : chaque facture porte un numéro supérieur à la précédente, sans trou dans la numérotation.
• Unicité : chaque numéro ne peut être attribué qu'une seule fois.
• Format libre mais cohérent : vous pouvez choisir le format qui vous convient, à condition de le conserver tout au long de l'exercice.

Exemples de formats acceptés

Les erreurs fréquentes à éviter

• Sauter un numéro : si vous passez de FA-015 à FA-017, l'administration considérera qu'il manque une facture.
• Utiliser des lettres aléatoires : la numérotation doit permettre de reconstituer l'ordre chronologique.
• Réinitialiser la numérotation en cours d'année sans changer de préfixe.
• Attribuer le même numéro à deux factures : même si elles concernent des clients différents.

Un logiciel de facturation gère automatiquement la numérotation et vous protège contre toutes ces erreurs.

La conservation des factures

Durée et format de conservation

En tant qu'auto-entrepreneur, vous devez conserver vos factures émises et reçues pendant :

• 10 ans au titre des obligations commerciales (article L123-22 du Code de commerce)
• 6 ans au titre des obligations fiscales (article L102 B du Livre des procédures fiscales)

En pratique, conservez tout pendant 10 ans pour être tranquille.

Les formats acceptés

• Format papier : original ou copie conforme
• Format numérique : PDF, ou tout format électronique garantissant l'intégrité du document (pas de fichier Word ou Excel modifiable)
• Format mixte : vous pouvez numériser vos factures papier et les conserver uniquement en numérique, à condition de respecter les conditions de l'article A102 B-2 du Livre des procédures fiscales (reproduction à l'identique, horodatage, etc.)

La déclaration URSSAF et le lien avec la facturation

Comment déclarer votre chiffre d'affaires

En tant qu'auto-entrepreneur, vous déclarez votre chiffre d'affaires encaissé (et non facturé) à l'URSSAF, mensuellement ou trimestriellement selon votre choix.

Points importants :

• Déclarez les sommes réellement encaissées : une facture émise mais non payée n'est pas à déclarer.
• Distinguez les catégories de revenus : ventes de marchandises, prestations de services BIC, prestations de services BNC. Chaque catégorie a un taux de cotisations différent.
• Les acomptes sont à déclarer au moment de leur encaissement, pas au moment de la facture finale.

Le livre des recettes

L'auto-entrepreneur est tenu de tenir un livre des recettes chronologique mentionnant pour chaque encaissement :

• La date d'encaissement
• Le montant
• L'origine (identité du client)
• La nature de la prestation
• Le mode de règlement (espèces, chèque, virement, carte bancaire)
• La référence de la facture

Un logiciel de facturation génère ce livre des recettes automatiquement à partir de vos factures et de vos encaissements enregistrés.

La facturation électronique obligatoire en 2026 : ce qui change pour les auto-entrepreneurs

Le calendrier applicable aux micro-entreprises

La réforme de la facturation électronique concerne aussi les auto-entrepreneurs assujettis à la TVA (y compris ceux en franchise en base) :

• Septembre 2026 : obligation de recevoir des factures électroniques (pour toutes les entreprises)
• Septembre 2027 : obligation d'émettre des factures électroniques pour les TPE et micro-entreprises

Ce que cela implique concrètement

Vos factures devront être émises dans un format structuré (Factur-X, UBL ou CII) via une plateforme certifiée. Le simple envoi d'un PDF par email ne sera plus conforme.

Vous devrez :

• Utiliser un logiciel compatible avec la facturation électronique
• Passer par une Plateforme de Dématérialisation Partenaire (PDP) ou par le Portail Public de Facturation (PPF)
• Transmettre des données de facturation à l'administration (e-reporting) pour vos transactions B2C

L'impact sur les auto-entrepreneurs non assujettis à la TVA

Même si vous êtes en franchise de TVA, vous êtes concerné par la réforme. Vous devrez émettre des factures au format électronique et transmettre les données via e-reporting pour les opérations non soumises à l'e-invoicing (ventes aux particuliers, ventes à l'export, etc.).

Top 5 des logiciels de facturation pour auto-entrepreneurs en 2026

Les critères de sélection spécifiques aux auto-entrepreneurs

Un auto-entrepreneur a des besoins différents d'une PME de 20 salariés :

• Prix accessible : le budget est souvent serré au démarrage
• Simplicité : pas besoin de 50 fonctionnalités, mais les essentielles doivent être impeccables
• Mention TVA non applicable : gérée automatiquement
• Livre des recettes : généré automatiquement
• Conformité e-invoicing : indispensable dès 2026
• Déclaration URSSAF facilitée : calcul automatique du CA à déclarer

Comparatif des 5 meilleures solutions

Analyse détaillée

Plus Que Pro Solution

Plus Que Pro Solution n'est pas spécifiquement conçu pour les auto-entrepreneurs, mais sa polyvalence et sa qualité en font un excellent choix pour les micro-entrepreneurs qui veulent un outil fiable et évolutif.

Pourquoi le choisir : si vous prévoyez de développer votre activité (embauche, passage en société), vous n'aurez pas à changer d'outil. Les fonctionnalités de paiement en ligne et de relances automatiques sont un avantage décisif pour la trésorerie. Le support téléphonique est rassurant pour les entrepreneurs qui débutent.

Point d'attention : le tarif de 29 euros/mois peut sembler élevé pour un auto-entrepreneur qui débute, mais le retour sur investissement est rapide grâce aux paiements accélérés et au temps gagné.

Abby

Abby est une solution française conçue spécifiquement pour les auto-entrepreneurs et micro-entrepreneurs. Elle propose un accompagnement complet : facturation, déclaration URSSAF, suivi du chiffre d'affaires et aide à la déclaration d'impôts.

Pourquoi le choisir : c'est le logiciel le plus complet pour les démarches administratives spécifiques aux auto-entrepreneurs. La déclaration URSSAF intégrée est un vrai plus.

Point d'attention : la version gratuite est très limitée (5 documents par mois). La conformité e-invoicing n'est disponible que sur la formule payante.

Henrri

Henrri est un logiciel de facturation gratuit édité par Rivalis. Il permet de créer des devis et factures sans limite de volume, ce qui est rare pour une solution gratuite.

Pourquoi le choisir : si votre seul besoin est de créer des devis et factures conformes sans dépenser un centime.

Point d'attention : pas de paiement en ligne, pas de relances automatiques, pas de livre des recettes, conformité e-invoicing partielle. Vous atteindrez vite les limites si votre activité se développe.

Tiime

Tiime est un logiciel de facturation et comptabilité qui fonctionne en partenariat avec des experts-comptables. La version gratuite est fonctionnelle pour la facturation de base.

Pourquoi le choisir : si vous travaillez avec un expert-comptable qui utilise déjà l'écosystème Tiime.

Point d'attention : les fonctionnalités avancées (relances, e-invoicing complet) nécessitent la formule payante. Le support est limité en version gratuite.

Freebe

Freebe est un outil de gestion conçu exclusivement pour les freelances et auto-entrepreneurs. Il combine facturation, suivi du CA, simulation de cotisations et aide à la déclaration.

Pourquoi le choisir : si vous voulez un outil tout-en-un pour gérer votre activité d'auto-entrepreneur au quotidien.

Point d'attention : pas de version gratuite. La conformité e-invoicing est encore en cours de déploiement.

Les bonnes pratiques de facturation pour auto-entrepreneurs

10 règles d'or à appliquer dès le premier jour

1. Facturez immédiatement après chaque prestation ou vente. Ne laissez pas les factures s'accumuler.
2. Utilisez un logiciel dédié dès le départ, même gratuit. Ne commencez pas avec Word ou Excel, vous le regretterez.
3. Vérifiez vos mentions obligatoires : la mention "TVA non applicable, article 293 B du CGI" doit figurer sur chaque facture si vous êtes en franchise.
4. Respectez la numérotation : ne sautez jamais un numéro, ne modifiez jamais une facture émise (émettez un avoir si nécessaire).
5. Conservez tout : chaque facture, chaque devis signé, chaque avoir, pendant 10 ans minimum.
6. Séparez vos comptes : utilisez un compte bancaire dédié à votre activité professionnelle (obligatoire au-delà de 10 000 euros de CA sur 2 années consécutives).
7. Suivez vos encaissements : ce que vous déclarez à l'URSSAF, c'est le CA encaissé, pas le CA facturé.
8. Relancez rapidement : n'attendez pas 3 mois pour relancer un impayé. Le taux de recouvrement chute drastiquement après 60 jours.
9. Préparez la facturation électronique : choisissez dès maintenant un logiciel conforme pour ne pas être pris au dépourvu.
10. Surveillez vos seuils : dépassement du seuil de CA, dépassement du seuil de franchise de TVA. Votre logiciel doit vous alerter.

FAQ : la facturation en auto-entrepreneur

Un auto-entrepreneur doit-il facturer avec TVA ?

Non, tant que vous bénéficiez de la franchise en base de TVA (en dessous des seuils). Vous facturez un montant global sans distinction HT/TTC et mentionnez "TVA non applicable, article 293 B du CGI". Si vous dépassez les seuils, vous devenez redevable de la TVA et devez alors facturer avec TVA.

Puis-je facturer sans numéro SIRET ?

Non. Le numéro SIRET est obligatoire sur toutes vos factures. Si vous n'avez pas encore reçu votre SIRET, vous pouvez mentionner "SIRET en cours d'attribution" temporairement, mais régularisez dès réception.

Comment faire un avoir en auto-entrepreneur ?

Un avoir s'émet comme une facture, mais avec un montant négatif. Il doit porter un numéro dans votre séquence de numérotation (ou dans une séquence dédiée aux avoirs) et faire référence à la facture d'origine. Un logiciel de facturation gère cela automatiquement.

Dois-je facturer en euros ?

La facture doit mentionner le montant en euros. Vous pouvez indiquer un montant dans une autre devise à titre informatif, mais le montant en euros fait foi.

Que risque-t-on en cas de facture non conforme ?

Les sanctions peuvent être lourdes : 15 euros par mention manquante ou inexacte (plafonné à 25 % du montant de la facture), et jusqu'à 75 000 euros d'amende pour défaut de facturation. En cas de contrôle fiscal, des factures non conformes peuvent entraîner un redressement.

La facturation électronique est-elle obligatoire pour les auto-entrepreneurs ?

Oui. Tous les assujettis à la TVA sont concernés, y compris les auto-entrepreneurs en franchise en base. L'obligation de recevoir des factures électroniques s'applique dès septembre 2026, et l'obligation d'émettre dès septembre 2027 pour les TPE/micro-entreprises.

Conclusion : anticipez pour facturer sereinement

La facturation en auto-entrepreneur n'est pas compliquée quand on est bien équipé. Le plus important est de partir sur de bonnes bases dès le début : un logiciel conforme, une numérotation rigoureuse et des habitudes de facturation régulières.

Avec la facturation électronique qui arrive, c'est le moment idéal pour adopter un outil professionnel. Plus Que Pro Solution vous accompagne dans cette transition avec une solution complète, conforme et un support humain disponible par téléphone.

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